                         SEQUENCE LISTING

<110>  SIGMA-ALDRICH CO.
       CHEN, Fuqiang
 
<120>  DETECTION OF MATURE SMALL RNA MOLECULES

<130>  47497-122857

<150>  US 11/672,591
<151>  2007-02-08

<160>  59    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(1)
<223>  PHOSPHATE

<400>  1
ugagguagua gguuguauag uu                                                22


<210>  2
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  2
ugagguagua gguuguauag uu                                                22


<210>  3
<211>  93
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  5' Linker


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (93)..(93)
<223>  ribonucleotide

<400>  3
ggcaggtaat acgactcact ataggtcgag agtcagggag cactccagct gcgaccagga       60

gaggtgtctc agcagagtac ctgccagcaa ctg                                    93


<210>  4
<211>  18
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  4
uacuaccuca caguugcu                                                     18


<210>  5
<211>  18
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  5
cgugcugcua caguugcu                                                     18


<210>  6
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  6
aactatacaa cctactacct cac                                               23


<210>  7
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Forward primer

<400>  7
ggcaggtaat acgactcact a                                                 21


<210>  8
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Mus musculus

<400>  8
uagcagcacg uaaauauugg cg                                                22


<210>  9
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  9
cgccaatatt tacgtgctgc tac                                               23


<210>  10
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(7)
<223>  locked nucleic acid

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (11)..(11)
<223>  locked nucleic acid

<400>  10
cgccaatatt tacgtgctgc ta                                                22


<210>  11
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  11
cgccaatatt tacgtgctgc ta                                                22


<210>  12
<211>  93
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  5' Linker

<400>  12
ggcaggtaat acgactcact ataggtcgag agtcagggag cactccagct gcgaccagga       60

gaggtgtctc agcagagtac ctgccagcaa ctg                                    93


<210>  13
<211>  91
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  5' Linker


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (91)..(91)
<223>  ribonucleotide

<400>  13
ggcaggtaat acgactcact ataggtcgag agtcagggag cactccagct gcgaccagga       60

gaggtgtctc agcagagtac ctgcccaatg a                                      91


<210>  14
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  14
ugcugcuauc auug                                                         14


<210>  15
<211>  16
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  5' Linker

<400>  15
cgugcugcua ucauug                                                       16


<210>  16
<211>  93
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  5' Linker


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (93)..(93)
<223>  ribonucleotide

<400>  16
ggcaggtaat acgactcact ataggtcgag agtcagggag cactccagct gcgaccagga       60

gaggtgtctc agcagagtac ctgccagcaa tga                                    93


<210>  17
<211>  16
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  17
ugcugcuauc auugcu                                                       16


<210>  18
<211>  18
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  18
cgugcugcua ucauugcu                                                     18


<210>  19
<211>  95
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  5' Linker


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (95)..(95)
<223>  ribonucleotide

<400>  19
ggcaggtaat acgactcact ataggtcgag agtcagggag cactccagct gcgaccagga       60

gaggtgtctc agcagagtac ctgccagagc aatga                                  95


<210>  20
<211>  20
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  20
cgugcugcua ucauugcucu                                                   20


<210>  21
<211>  97
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  5' Linker


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (97)..(97)
<223>  ribonucleotide

<400>  21
ggcaggtaat acgactcact ataggtcgag agtcagggag cactccagct gcgaccagga       60

gaggtgtctc agcagagtac ctgcctcaga gcaatga                                97


<210>  22
<211>  24
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  22
uacgugcugc uaucauugcu cuga                                              24


<210>  23
<211>  91
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  5' Linker


<220>
<221>  misc_feature
<222>  (91)..(91)
<223>  ribonucleotide

<400>  23
ggcaggtaat acgactcact ataggtcgag agtcagggag cactccagct gcgaccagga       60

gaggtgtctc agcagagtac ctgcccaaca g                                      91


<210>  24
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  24
ugcugcuacu guug                                                         14


<210>  25
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  25
uagcuuauca gacugauguu ga                                                22


<210>  26
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  26
auaagcuacu guug                                                         14


<210>  27
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  27
tcaacatcag tctgataagc tac                                               23


<210>  28
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  28
uggaauguaa agaaguaugu a                                                 21


<210>  29
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  29
acauuccacu guug                                                         14


<210>  30
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  30
tacatacttc tttacattcc ac                                                22


<210>  31
<211>  23
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  31
gcaaagcaca cggccugcag aga                                               23


<210>  32
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  32
ugcuuugccu guug                                                         14


<210>  33
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  33
tctctgcagg ccgtgtgctt tgcc                                              24


<210>  34
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  34
aucacauugc cagggauuac c                                                 21


<210>  35
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  35
caaugugauc uguug                                                        15


<210>  36
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  36
ggtaatccct ggcaatgtga tc                                                22


<210>  37
<211>  22
<212>  RNA
<213>  Homo sapiens

<400>  37
cagugcaaug uuaaaagggc au                                                22


<210>  38
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  38
uugcacugcu guug                                                         14


<210>  39
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  39
atgccctttt aacattgcac tgc                                               23


<210>  40
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  40
cuaccucacu guug                                                         14


<210>  41
<211>  20
<212>  RNA
<213>  Arabidopsis thaliana

<400>  41
ugacagaaga gagugagcac                                                   20


<210>  42
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  42
uucugucacu guug                                                         14


<210>  43
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  43
gtgctcactc tcttctgtca c                                                 21


<210>  44
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Arabidopsis thaliana

<400>  44
agaaucuuga ugaugcugca u                                                 21


<210>  45
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  45
caagauucuc uguug                                                        15


<210>  46
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  46
atgcagcatc atcaagattc tc                                                22


<210>  47
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Arabidopsis thaliana

<400>  47
cagccaagga ugacuugccg a                                                 21


<210>  48
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  48
cuuggcugcu guug                                                         14


<210>  49
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  49
tcggcaagtc atccttggct gc                                                22


<210>  50
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Arabidopsis thaliana

<400>  50
uuuggauuga agggagcucu a                                                 21


<210>  51
<211>  15
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  51
caauccaaac uguug                                                        15


<210>  52
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  52
tagagctccc ttcaatccaa ac                                                22


<210>  53
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Arabidopsis thaliana

<400>  53
ugauugagcc gugucaauau c                                                 21


<210>  54
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  54
cucaaucacu guug                                                         14


<210>  55
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  55
gatattgaca cggctcaatc ac                                                22


<210>  56
<211>  21
<212>  RNA
<213>  Arabidopsis thaliana

<400>  56
ucggaccagg cuucauuccc c                                                 21


<210>  57
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template

<400>  57
ugguccgacu guug                                                         14


<210>  58
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Reverse primer

<400>  58
ggggaatgaa gcctggtccg ac                                                22


<210>  59
<211>  14
<212>  RNA
<213>  Artificial

<220>
<223>  Ligation template


<220>
<221>  misc_feature
<223>  N = a, c, g or u

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (1)..(7)
<223>  n is a, c, g, or u

<400>  59
nnnnnnnacu guug                                                         14


