                         SEQUENCE LISTING

<110>  SANFORD-BURNHAM MEDICAL RESEARCH INSTITUTE
       WARE, Carl F.
       SEDY, John
 
<120>  COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATING AUTOIMMUNE AND INFLAMMATORY
        DISORDERS

<130>  BURN1610-2WO

<150>  US 61/597,634
<151>  2012-02-10

<150>  US 61/560,081
<151>  2011-11-15

<160>  82    

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  1
agtcagatct gcgtgcagga tgctgttg                                          28


<210>  2
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  2
agtcctcgag ggcttacaaa gcttgaaggg                                        30


<210>  3
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  3
agtcagatct gtgcaggaaa tgaagacatt g                                      31


<210>  4
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  4
agtcctcgag tcagaaacag acttaactcc tcacac                                 36


<210>  5
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  5
agctagatct gcgtgcagga tgctgatg                                          28


<210>  6
<211>  34
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  6
agtcctcgag aaggcttaca aagcttgaag gacc                                   34


<210>  7
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  7
aaacccgaag cagtgcaatt aggaaatcag tg                                     32


<210>  8
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  8
taattgcact gcttcgggtt tgcatatttc ag                                     32


<210>  9
<211>  34
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  9
ttaggaaatg cgtgttgtcc cccatgtaaa caag                                   34


<210>  10
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  10
gggacaacac gcatttccta attgcacttc ttc                                    33


<210>  11
<211>  34
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  11
cagtgttgtg ccccatgtaa acaaggatat cgtg                                   34


<210>  12
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  12
tttacatggg gcacaacact gatttcctaa ttg                                    33


<210>  13
<211>  35
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  13
tgtaaacaag catatcgtgt tacaggacaa tgtac                                  35


<210>  14
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  14
aacacgatat gcttgtttac atgggggaca acactg                                 36


<210>  15
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  15
cccccatgta aacaaggagc tcgtgttaca ggacaatg                               38


<210>  16
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  16
cattgtcctg taacacgagc tccttgttta catggggg                               38


<210>  17
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  17
caaggatatg ctgttacagg acaatgtacg caatatac                               38


<210>  18
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  18
tcctgtaaca gcatatcctt gtttacatgg ggg                                    33


<210>  19
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  19
tatcgtgttg caggacaatg tacgcaatat acg                                    33


<210>  20
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  20
acattgtcct gcaacacgat atccttgttt acatgg                                 36


<210>  21
<211>  35
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  21
cgtgttacag cacaatgtac gcaatatacg agtac                                  35


<210>  22
<211>  35
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  22
cgtacattgt gctgtaacac gatatccttg tttac                                  35


<210>  23
<211>  45
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  23
aaacaaggat atcgtgttac aaaacaatgt acgcaatata cgagt                       45


<210>  24
<211>  45
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  24
actcgtatat tgcgtacatt gttttgtaac acgatatcct tgttt                       45


<210>  25
<211>  34
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  25
caatgtacgg catatacgag tacaacatgt acag                                   34


<210>  26
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  26
actcgtatat gccgtacatt gtcctgtaac acgatatc                               38


<210>  27
<211>  35
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  27
acgcaatatg cgagtacaac atgtacactt tgccc                                  35


<210>  28
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  28
tgttgtactc gcatattgcg tacattgttc tgtaac                                 36


<210>  29
<211>  34
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  29
gtatcagggg cttacaattg taccaattgc actg                                   34


<210>  30
<211>  35
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  30
acaattgtaa gcccctgata catacgtacc gttag                                  35


<210>  31
<211>  35
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  31
ttttccgttg caggcgtcca acatcacaag caacg                                  35


<210>  32
<211>  34
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  32
ttggacgcct gcaacggaaa atgacgtata attc                                   34


<210>  33
<211>  43
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  33
catgtgatgt agcgctttat ataaagagac aatctgaaca ctc                         43


<210>  34
<211>  39
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  34
ctttatataa agcgctacat cacatgattc tttcccatg                              39


<210>  35
<211>  43
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  35
atgtgatgta cagcattata taaagagaca atctgaacac tcc                         43


<210>  36
<211>  41
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  36
ttgtctcttt atataatgct gtacatcaca tgattctttc c                           41


<210>  37
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  37
ctttatataa aggaccaatc tgaacactcc atcttagc                               38


<210>  38
<211>  45
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  38
gtgttcagat tggtccttta tataaagctg tacatcacat gattc                       45


<210>  39
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  39
agagacaatc tgcacactcc atcttagcag gagatcc                                37


<210>  40
<211>  41
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  40
aagatggagt gtggagattg tctctttata taaagctgta c                           41


<210>  41
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  41
ctttgaacta gcatgccctg tgaaatactg tgctaac                                37


<210>  42
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  42
tcacagggca tgctagttca aagggatctc ctgctaag                               38


<210>  43
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  43
gaactagaat gcgctgtgaa atactgtgct aacaggc                                37


<210>  44
<211>  35
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  44
gtatttcaca gcgcattcta gttcaaaggg atctc                                  35


<210>  45
<211>  40
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  45
acaagttggg cggaagagaa gaacatttca tttttcattc                             40


<210>  46
<211>  42
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  46
cttctcttcc gcccaacttg tttgtctatc ttcaagtttt ac                          42


<210>  47
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  47
tgttctgcaa attttcagtc taatctcatt gaaagc                                 36


<210>  48
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  48
gattagactg aaaatttgca gaacagcggt atgaccc                                37


<210>  49
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  49
gctgttctgc attttttcag tctaatctca ttgaaagc                               38


<210>  50
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  50
tagactgaaa aaatgcagaa cagcggtatg ac                                     32


<210>  51
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  51
gttctgcaaa tgctcagtct aatctcattg aaagccac                               38


<210>  52
<211>  35
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  52
gagattagac tgagcatttg cagaacagcg gtatg                                  35


<210>  53
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  53
caaattttca gcataatctc attgaaagcc actcaac                                37


<210>  54
<211>  34
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  54
caatgagatt atgctgaaaa tttgcagaac agcg                                   34


<210>  55
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  55
cattgaaagc gactcaacaa ctctttatgt gacagatg                               38


<210>  56
<211>  40
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  56
gttgttgagt cgctttcaat gagattagac tgaaaatttg                             40


<210>  57
<211>  42
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  57
tgaaagccac catacaactc tttatgtgac agatgtaaaa ag                          42


<210>  58
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  58
aagagttgta tggtggcttt caatgagatt agactg                                 36


<210>  59
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  59
actaccgccc agcagtgt                                                     18


<210>  60
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  60
gtgtcatggg gagaaccaa                                                    19


<210>  61
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  61
ggcggtgcct atcactgt                                                     18


<210>  62
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  62
ttctgaaacc ccagtccttg                                                   20


<210>  63
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  63
tctcttgctg ttgctgatgg                                                   20


<210>  64
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  64
ctcgtgagac cttcgctctt                                                   20


<210>  65
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  65
cagcctcttc tccttcctga t                                                 21


<210>  66
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  66
gccagagggc tgattagaga                                                   20


<210>  67
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  67
agcagctccc cactgggtat g                                                 21


<210>  68
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  68
gattaggcca actgtggagc a                                                 21


<210>  69
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  69
gcctctactc atcactacct gttttc                                            26


<210>  70
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  70
tcagagagtt cattttgctt tcc                                               23


<210>  71
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  71
cctcactaca tccgtgaact cc                                                22


<210>  72
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  72
ctgctggtat ccttggcttc                                                   20


<210>  73
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  73
cccctggttg ttgtagcag                                                    19


<210>  74
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  74
gtaggaggtg cgagttcagg                                                   20


<210>  75
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  75
cttcgactgc gtgctcaag                                                    19


<210>  76
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  76
gtaggtggcg aggggaag                                                     18


<210>  77
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  77
ggatctggcc cttgaacctt                                                   20


<210>  78
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Primer

<400>  78
gaaactggcg gaaaccca                                                     18


<210>  79
<211>  283
<212>  PRT
<213>  Homo sapiens

<400>  79

Met Glu Pro Pro Gly Asp Trp Gly Pro Pro Pro Trp Arg Ser Thr Pro 
1               5                   10                  15      


Lys Thr Asp Val Leu Arg Leu Val Leu Tyr Leu Thr Phe Leu Gly Ala 
            20                  25                  30          


Pro Cys Tyr Ala Pro Ala Leu Pro Ser Cys Lys Glu Asp Glu Tyr Pro 
        35                  40                  45              


Val Gly Ser Glu Cys Cys Pro Lys Cys Ser Pro Gly Tyr Arg Val Lys 
    50                  55                  60                  


Glu Ala Cys Gly Glu Leu Thr Gly Thr Val Cys Glu Pro Cys Pro Pro 
65                  70                  75                  80  


Gly Thr Tyr Ile Ala His Leu Asn Gly Leu Ser Lys Cys Leu Gln Cys 
                85                  90                  95      


Gln Met Cys Asp Pro Ala Met Gly Leu Arg Ala Ser Arg Asn Cys Ser 
            100                 105                 110         


Arg Thr Glu Asn Ala Val Cys Gly Cys Ser Pro Gly His Phe Cys Ile 
        115                 120                 125             


Val Gln Asp Gly Asp His Cys Ala Ala Cys Arg Ala Tyr Ala Thr Ser 
    130                 135                 140                 


Ser Pro Gly Gln Arg Val Gln Lys Gly Gly Thr Glu Ser Gln Asp Thr 
145                 150                 155                 160 


Leu Cys Gln Asn Cys Pro Pro Gly Thr Phe Ser Pro Asn Gly Thr Leu 
                165                 170                 175     


Glu Glu Cys Gln His Gln Thr Lys Cys Ser Trp Leu Val Thr Lys Ala 
            180                 185                 190         


Gly Ala Gly Thr Ser Ser Ser His Trp Val Trp Trp Phe Leu Ser Gly 
        195                 200                 205             


Ser Leu Val Ile Val Ile Val Cys Ser Thr Val Gly Leu Ile Ile Cys 
    210                 215                 220                 


Val Lys Arg Arg Lys Pro Arg Gly Asp Val Val Lys Val Ile Val Ser 
225                 230                 235                 240 


Val Gln Arg Lys Arg Gln Glu Ala Glu Gly Glu Ala Thr Val Ile Glu 
                245                 250                 255     


Ala Leu Gln Ala Pro Pro Asp Val Thr Thr Val Ala Val Glu Glu Thr 
            260                 265                 270         


Ile Pro Ser Phe Thr Gly Arg Ser Pro Asn His 
        275                 280             


<210>  80
<211>  78
<212>  PRT
<213>  Homo sapiens

<400>  80

Cys Lys Glu Asp Glu Tyr Pro Val Gly Ser Glu Cys Cys Pro Lys Cys 
1               5                   10                  15      


Ser Pro Gly Tyr Arg Val Lys Glu Ala Cys Gly Glu Leu Thr Gly Thr 
            20                  25                  30          


Val Cys Glu Pro Cys Pro Pro Gly Thr Tyr Ile Ala His Leu Asn Gly 
        35                  40                  45              


Leu Ser Lys Cys Leu Gln Cys Gln Met Cys Asp Pro Ala Met Gly Leu 
    50                  55                  60                  


Arg Ala Ser Arg Asn Cys Ser Arg Thr Glu Asn Ala Val Cys 
65                  70                  75              


<210>  81
<211>  73
<212>  PRT
<213>  Human herpesvirus 5

<400>  81

Cys Lys Pro Glu Glu Val Gln Leu Gly Asn Gln Cys Cys Pro Pro Cys 
1               5                   10                  15      


Lys Gln Gly Tyr Arg Val Thr Gly Gln Cys Thr Gln Tyr Thr Ser Thr 
            20                  25                  30          


Thr Cys Thr Leu Cys Pro Asn Gly Thr Tyr Val Ser Gly Leu Tyr Asn 
        35                  40                  45              


Cys Thr Asn Cys Thr Glu Cys Asn Asp Thr Glu Val Thr Ile Arg Asn 
    50                  55                  60                  


Cys Thr Ser Thr Asn Asn Thr Val Cys 
65                  70              


<210>  82
<211>  78
<212>  PRT
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Synthetic construct: Consensus sequence


<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (3)..(3)
<223>  Xaa is E or P

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (4)..(4)
<223>  Xaa is D or E

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (6)..(6)
<223>  Xaa is Y or V

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (7)..(7)
<223>  Xaa is P or Q

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (8)..(8)
<223>  Xaa is V or L

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (10)..(10)
<223>  Xaa is S or N

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (11)..(11)
<223>  Xaa is E or Q

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (15)..(15)
<223>  Xaa is K or P

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (17)..(17)
<223>  Xaa is S or K

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (18)..(18)
<223>  Xaa is P or Q

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (23)..(23)
<223>  Xaa is K or T

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (24)..(24)
<223>  Xaa is E or G

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (25)..(25)
<223>  Xaa is A or Q

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (27)..(27)
<223>  Xaa is G or T

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (28)..(28)
<223>  Xaa is E or Q

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (29)..(29)
<223>  Xaa is L or Y

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (31)..(31)
<223>  Xaa is G or S

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (33)..(33)
<223>  Xaa is V or T

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (35)..(35)
<223>  Xaa is E or T

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (36)..(36)
<223>  Xaa is P or L

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (39)..(39)
<223>  Xaa is P or N

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (43)..(43)
<223>  Xaa is I or V

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (44)..(44)
<223>  Xaa is A or S

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (50)..(50)
<223>  Xaa is S or Y

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (51)..(51)
<223>  Xaa is K or N

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (53)..(53)
<223>  Xaa is L or T

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (54)..(54)
<223>  Xaa is Q or N

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (56)..(56)
<223>  Xaa is Q or T

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (57)..(57)
<223>  Xaa is M or E

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (59)..(59)
<223>  Xaa is D or N

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (60)..(60)
<223>  Xaa is P or D

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (61)..(61)
<223>  Xaa is A or T

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (62)..(62)
<223>  Xaa is M or E

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (65)..(65)
<223>  Xaa is R or V

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (66)..(66)
<223>  Xaa is A or T

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (67)..(67)
<223>  Xaa is S or I

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (71)..(71)
<223>  Xaa is S or T

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (72)..(72)
<223>  Xaa is R or S

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (74)..(74)
<223>  Xaa is E or N

<220>
<221>  MISC_FEATURE
<222>  (76)..(76)
<223>  Xaa is A or T

<400>  82

Cys Lys Xaa Xaa Glu Xaa Xaa Xaa Gly Xaa Xaa Cys Cys Pro Xaa Cys 
1               5                   10                  15      


Xaa Xaa Gly Tyr Arg Val Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Thr Xaa Thr 
            20                  25                  30          


Xaa Cys Xaa Xaa Cys Pro Xaa Gly Thr Tyr Xaa Xaa His Leu Asn Gly 
        35                  40                  45              


Leu Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Leu 
    50                  55                  60                  


Xaa Xaa Xaa Arg Asn Cys Xaa Xaa Thr Xaa Asn Xaa Val Cys 
65                  70                  75              


