                         SEQUENCE LISTING

<110>  Whitehead Institute for Biomedical Research
       The Brigham and Women's Hospital, Inc.
 
<120>  METHODS AND COMPOSITIONS RELATING TO PROTEASOME INHIBITOR 
       RESISTANCE

<130>  WIBR-153-WO1

<140>  PCT/US2016/041207
<141>  2016-07-06

<150>  US 62/189,173
<151>  2015-07-06

<150>  US 62/336,198
<151>  2016-05-13

<150>  US 62/296,558
<151>  2016-02-17

<160>  110   

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  1
ccacatttgt agcgaacact t                                                 21


<210>  2
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  2
gctggctcaa atcgtgaaga t                                                 21


<210>  3
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  3
ccctataaca tggcccacaa t                                                 21


<210>  4
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  4
cgaaacatta ttctaggcaa a                                                 21


<210>  5
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  5
gaggataaac agcttcaaga t                                                 21


<210>  6
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  6
gcacagagga acgaactaaa t                                                 21


<210>  7
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  7
gaagattcat tctcggaaga t                                                 21


<210>  8
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  8
caaggttatc atggctacta a                                                 21


<210>  9
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  9
tgctccatct atcatcttca t                                                 21


<210>  10
<211>  38
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  primer

<400>  10
aaaaaaccgg tcgccaccat ggtgagcaag ggcgagga                               38


<210>  11
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  primer

<400>  11
tttttatcga ttacttgtac agctcgtcca tgccga                                 36


<210>  12
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  primer

<400>  12
tcgacctcga gtaccaccac act                                               23


<210>  13
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  primer

<400>  13
aaacgacggg atccgccatg tca                                               23


<210>  14
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  primer

<400>  14
tatccagccc tcactccttc tct                                               23


<210>  15
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  primer

<400>  15
ctgtggatga gtcagaggct                                                   20


<210>  16
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  primer

<400>  16
ttggctatga ggtgtgtcgt                                                   20


<210>  17
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  primer

<400>  17
acagccatta caggtggcaa                                                   20


<210>  18
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  primer

<400>  18
gtccacaccg actctcatcc                                                   20


<210>  19
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  primer

<400>  19
ggttggttta gcggtttagt tttcg                                             25


<210>  20
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  primer

<400>  20
catccaatct tccaaaaaca taacgct                                           27


<210>  21
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  21
ccatgaggtt tcctcccaaa t                                                 21


<210>  22
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  22
gcagggcttc ttcacttcaa a                                                 21


<210>  23
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  23
tttcccacac acagctcata t                                                 21


<210>  24
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  24
gccgcaaagt gttactatta t                                                 21


<210>  25
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  25
acgctgagta cttcgaaatg t                                                 21


<210>  26
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  26
ctatgatctc tccagtaaat a                                                 21


<210>  27
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  27
cdsgacactt caggtgcttg attt                                              24


<210>  28
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  28
agatggtctc attaagcttt a                                                 21


<210>  29
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  29
cagacggtcg acattgaatt t                                                 21


<210>  30
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  30
agaatcgtcg tatgcagtga a                                                 21


<210>  31
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  31
tgaccctgaa gttcatctgc a                                                 21


<210>  32
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  32
gctcagtgtg gtggatcatt t                                                 21


<210>  33
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  33
gccatcaacg aactcatgaa a                                                 21


<210>  34
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  34
gctgaggaag ttggagttga a                                                 21


<210>  35
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  35
gtcggcttac ggcggtgatt t                                                 21


<210>  36
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  36
attccgtatt ggtcatcatt g                                                 21


<210>  37
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  37
ccgacgtgga aaggaaatta t                                                 21


<210>  38
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  38
ggacatgcag tcgggtatta t                                                 21


<210>  39
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  39
ctggtgtctt tgtactttga t                                                 21


<210>  40
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  40
cctcatttgg tgcatctgta t                                                 21


<210>  41
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  41
agtcaacgag tatctgaaca a                                                 21


<210>  42
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  42
cagacggacg actcgcttat t                                                 21


<210>  43
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  43
ccctgacgac tgtgagttca a                                                 21


<210>  44
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  44
tgccggaaag tcaacgagta t                                                 21


<210>  45
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  45
gacagccttt cgcaagacat a                                                 21


<210>  46
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  46
caggaactgt ccaggtttat t                                                 21


<210>  47
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  47
cttgaagtgt tgcacagtct t                                                 21


<210>  48
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  48
gcagtaccaa gaaactatca a                                                 21


<210>  49
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  49
tatcgacatc ccgtatctta g                                                 21


<210>  50
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  50
gtagacagat tagcaggaat t                                                 21


<210>  51
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  51
gactgttata atggtgtata t                                                 21


<210>  52
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  52
ccttcctatc aaacttcgat t                                                 21


<210>  53
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  53
gccaaacagg tcatcgagta t                                                 21


<210>  54
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  54
gctgaccaaa cagcagctaa t                                                 21


<210>  55
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  55
gatgacagac tacgccaaga a                                                 21


<210>  56
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  56
cccagctcaa atgctactac t                                                 21


<210>  57
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  57
gctggagtct aaattggact a                                                 21


<210>  58
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  58
cattggtgaa agtgctcgtt t                                                 21


<210>  59
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  59
cctcttacaa acccagagtt a                                                 21


<210>  60
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  60
cccattacaa agcatggtga a                                                 21


<210>  61
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  61
ccagacggtg aagaaggtga t                                                 21


<210>  62
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  62
tctggctctg tgtatgcata t                                                 21


<210>  63
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  63
cgaaataagg aacgcatctc t                                                 21


<210>  64
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  64
caatgtcgaa tctatgagct t                                                 21


<210>  65
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  65
caagctgcaa agacggaaat a                                                 21


<210>  66
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  66
agaaatgacc tgccgtgata t                                                 21


<210>  67
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  67
catcaggtgt ttcatacggt t                                                 21


<210>  68
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  68
gtacatgacg aagttaagga t                                                 21


<210>  69
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  69
ccacatgaag cagcacgact t                                                 21


<210>  70
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  70
gctgtcatgg atagtcctca a                                                 21


<210>  71
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  71
ccatactatg tgaaacctgt t                                                 21


<210>  72
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  72
ccctgcttaa cgagaaccat a                                                 21


<210>  73
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  73
ccctgtcaag aatatcacta a                                                 21


<210>  74
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  74
acaacagcca caacgtctat a                                                 21


<210>  75
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  75
cagattgatc aatgctaata t                                                 21


<210>  76
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  76
acagcagaac aagtctatat c                                                 21


<210>  77
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  77
catggactaa acagacatta t                                                 21


<210>  78
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  78
caagccatct atccaggcat t                                                 21


<210>  79
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  79
gcgggtctgc aagtggatga t                                                 21


<210>  80
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  80
gcgcagatca aggccaacta t                                                 21


<210>  81
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  81
aggtactggt gtgattatta t                                                 21


<210>  82
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  82
accagcttag acttgttcca a                                                 21


<210>  83
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  83
gaggataaac agcttcaaga t                                                 21


<210>  84
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  84
ccacatttgt agcgaacact t                                                 21


<210>  85
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  85
gctggctcaa atcgtgaaga t                                                 21


<210>  86
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  86
cgaaacatta ttctaggcaa a                                                 21


<210>  87
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  87
cacggagcaa tacagtgaca t                                                 21


<210>  88
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  88
gtgcagatgt tcattggaga t                                                 21


<210>  89
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  89
ccagcccaac acccaagtta a                                                 21


<210>  90
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  90
ctcagttcca gtacggctcc a                                                 21


<210>  91
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  91
gctcctggat gttgatccta a                                                 21


<210>  92
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  92
gcacagagga acgaactaaa t                                                 21


<210>  93
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  93
tcgtattaca acgtcgtgac t                                                 21


<210>  94
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  94
gaagattcat tctcggaaga t                                                 21


<210>  95
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  95
caaggttatc atggctacta a                                                 21


<210>  96
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  96
ccaacgtgac ctatcccatt a                                                 21


<210>  97
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  97
tgctccatct atcatcttca t                                                 21


<210>  98
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  98
gagcattgag gcccagtaag a                                                 21


<210>  99
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  99
acattggtgc agccctagtt t                                                 21


<210>  100
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  100
gagattgagg tgctggaaga a                                                 21


<210>  101
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  101
tgccgtcttg gaagccgatt t                                                 21


<210>  102
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  102
gcacggaata tagggttaga t                                                 21


<210>  103
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  103
acaatgaagc cattcgaaat g                                                 21


<210>  104
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  104
ctctcatcag ttctccgatt t                                                 21


<210>  105
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  105
gtggacaaca gtgagtatat g                                                 21


<210>  106
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  106
gttctactgt tgtcgtatat t                                                 21


<210>  107
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  107
gaagagttga aggagagtat t                                                 21


<210>  108
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  108
cactcggata tttgatatgt g                                                 21


<210>  109
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  109
gctcaagtga atgctgtcaa t                                                 21


<210>  110
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Unknown

<220>
<223>  shRNA

<400>  110
caagggtaac ttgaagatga t                                                 21


