                         SEQUENCE LISTING

<110>  F. Hoffmann-La Roche AG
       Roche Diagnostics GmbH
       Roche Molecular Systems, Inc.
 
<120>  COMPOSITIONS AND METHODS FOR DETECTION OF BACTERIA AND FUNGI 
       ASSOCIATED WITH BACTERIAL AND CANDIDA VAGINOSIS

<130>  P36606-WO-HS

<150>  63/132,438
<151>  2020-12-30

<150>  63/263,717
<151>  2021-11-08

<160>  102   

<170>  PatentIn version 3.5

<210>  1
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer GVAG_tuf_F_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  1
agctcccaat caacacccca                                                   20


<210>  2
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer GVAG_tuf_R_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  2
cacggagaag aagaccagtg ttatc                                             25


<210>  3
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe GVAG_tuf_Pb_1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` Coumarin

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  3
agaccaccac cgtcacctct atcgagacct tcc                                    33


<210>  4
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer GVAG_tuf_F_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (23)..(23)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  4
cccaatcaac accccagttg aga                                               23


<210>  5
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer GVAG_23s_F_4


<220>
<221>  modified_base
<222>  (23)..(23)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  5
ctgtaaggct gattccggtg atc                                               23


<210>  6
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer GVAG_23s_R_4


<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  6
cgagttcctt ggccaggatt c                                                 21


<210>  7
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe GVAG_23s_Pb_4


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` Coumarin

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  7
caacgtgagg tgtgattccg ctcgtaccc                                         29


<210>  8
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer GVAG_23s_F_6


<220>
<221>  modified_base
<222>  (19)..(19)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  8
agtgacgcgg gtaggtagc                                                    19


<210>  9
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer GVAG_23s_R_5


<220>
<221>  modified_base
<222>  (22)..(22)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  9
gcaagcagga tcaccggaat ca                                                22


<210>  10
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe GVAG_23s_Pb_5


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` Coumarin

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  10
ctgaggcgtg atgggtaggc tgtaaggc                                          28


<210>  11
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer GVAG_F1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  11
tgctccagaa tagctcttgg a                                                 21


<210>  12
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer GVAG_R1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (22)..(22)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  12
gccactaaac actttcccaa ca                                                22


<210>  13
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe GVAG_16s_Pb_1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` Coumarin

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  13
tgctggatgc tccaacttga cgcatg                                            26


<210>  14
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer AVAG_23s_F_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  14
gctgagtccg gttgggataa                                                   20


<210>  15
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer AVAG_23s_R_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (12)..(12)
<223>  7-deaza dG

<220>
<221>  modified_base
<222>  (23)..(23)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  15
ttgtctacaa ggggtcttac caa                                               23


<210>  16
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe AVAG_23s_Pb_1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (6)..(7)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  16
cgggaagccc atcccaagat gagttttcct                                        30


<210>  17
<211>  17
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer AVAG_tufA_F_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (17)..(17)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  17
gcctggcgac cacgtaa                                                      17


<210>  18
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer AVAG_tufA_R_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  18
tgtggccacc ttcacgaata                                                   20


<210>  19
<211>  37
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe AVAG_tufA_Pb_2


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (8)..(9)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  19
attcacccca ttgctatgga ggaaggtctt aagttcg                                37


<210>  20
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer AVAG_tufA_F_3


<220>
<221>  modified_base
<222>  (22)..(22)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  20
cactaaggtt ctctccgagc aa                                                22


<210>  21
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer AVAG_tufA_R_3


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  21
tcaatgtgag caacgttaat ggtaa                                             25


<210>  22
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe AVAG_tufA_Pb_3


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (6)..(7)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  22
cgacaaggct cctgaagagc gtcaacg                                           27


<210>  23
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer MEGA1_16s_F_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  23
ccgcgtgagt gaagaaggtc                                                   20


<210>  24
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer MEGA1_16s_R_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  24
ggtaccgtca cggacggata c                                                 21


<210>  25
<211>  35
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  MEGA1_16s_Pb_2


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (6)..(7)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  25
agctctgtta tacgggacga aaaagacgga tgcca                                  35


<210>  26
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer MEGA1_16s_F_4


<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  26
ccgcaatgga cgaaagtctg a                                                 21


<210>  27
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer MEGA1_16s_F_6


<220>
<221>  modified_base
<222>  (22)..(22)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  27
tcttccgcaa tggacgaaag tc                                                22


<210>  28
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer MEGA1_16s_R_6


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  28
gcatccgtct ttttcgtccc gtata                                             25


<210>  29
<211>  30
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe MEGA1_16s_Pb_6


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 BNlocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  29
caacgccgcg tgagtgaaga aggtcttcgg                                        30


<210>  30
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer BVAB2_16s_F_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  30
cccgcacaag cagtggatta                                                   20


<210>  31
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer BVAB2_16s_R_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (23)..(23)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  31
tgtctctctg tctccgaaga gaa                                               23


<210>  32
<211>  34
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe BVAB2_16s_Pb_1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (11)..(12)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  32
accttaccag gacttgacat cctctgacga ttca                                   34


<210>  33
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer BVAB2_16s_F_3


<220>
<221>  modified_base
<222>  (27)..(27)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  33
agtgtgatgt ttaaatccaa ggcttaa                                           27


<210>  34
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer BVAB2_16s_R_3


<220>
<221>  modified_base
<222>  (28)..(28)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  34
gtgttcctcc taatatctac gcatttta                                          28


<210>  35
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe BVAB2_16s_Pb_3


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (11)..(12)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  35
caaactgttt agcttgagtg ctggagagga tagtgg                                 36


<210>  36
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer BVAB2_16s_R_4


<220>
<221>  modified_base
<222>  (28)..(28)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  36
gttcctccta atatctacgc attttacc                                          28


<210>  37
<211>  40
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe BVAB2_16s_Pb_4


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(8)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  37
tcattacaaa ctgtttagct tgagtgctgg agaggatagt                             40


<210>  38
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer LBS_23s_F_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  38
tcaggggtta ctgaatccag ataaa                                             25


<210>  39
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer LBS_23s_R_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  39
acttagcata gatttgggga cctta                                             25


<210>  40
<211>  35
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe LBS_23s_Pb_1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  40
agtcagactg cgagtgataa gatccgtagt cgaaa                                  35


<210>  41
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer LBS_23s_F_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  41
gtgagaatcc tatccgccga a                                                 21


<210>  42
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer LBS_23s_R_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  42
cttgccttag gtcccgactt a                                                 21


<210>  43
<211>  22
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe LBS_23s_Pb_2


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(8)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  43
ttcctggggc aggctcgtcc gc                                                22


<210>  44
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer LBS_LDH_F_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (23)..(23)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  44
gctcgtgtat tacgtcaaga caa                                               23


<210>  45
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer LBS_LDH_R_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (27)..(27)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  45
gaagatatcg taagcaataa cctttgc                                           27


<210>  46
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe LBS_LDH_Pb_1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (6)..(7)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  46
tcgtgaccaa gttgttggtg ttgtaggtac tggtca                                 36


<210>  47
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer LBS_LDH_R_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  47
cctttgcgcc gaaaccttcc                                                   20


<210>  48
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer CVS_rRNA_F_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  48
caacggatct cttggttctc gcatc                                             25


<210>  49
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer CVS_rRNA_R_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (19)..(19)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  49
gggcgcaatg tgcgttcaa                                                    19


<210>  50
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe CVS_rRNA_Pb_1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  50
ctgcaattca tattacgtat cgcatttcgc tgcgtt                                 36


<210>  51
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer CVS_rRNA_F_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  51
gcgagagacc gatagcgaac a                                                 21


<210>  52
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer CVS_rRNA_R_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (24)..(24)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  52
gcccttccct ttcaacaatt tcac                                              24


<210>  53
<211>  45
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe CVS_rRNA_Pb_2


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  53
tttcactctc ttttcaaagt tcttttcatc tttccatcac tgtac                       45


<210>  54
<211>  32
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer CAPT_rRNA_F_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (32)..(32)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  54
aatgcgatac gtaatatgaa ttgcagatat tc                                     32


<210>  55
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer CAPT_rRNA_R_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (24)..(24)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  55
tttgagggag aaatgacgct caaa                                              24


<210>  56
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe CAPT_rRNA_Pb_1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  56
atcgaatctt tgaacgcaca ttgcgccctt tgg                                    33


<210>  57
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer CAPT_rRNA_F_6


<220>
<221>  modified_base
<222>  (27)..(27)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  57
aagaaaccaa cagggattgc cttagta                                           27


<210>  58
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer CAPT_rRNA_R_6


<220>
<221>  modified_base
<222>  (24)..(24)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  58
tcatctcatc gcacgggatt ctca                                              24


<210>  59
<211>  44
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe CAPT_rRNA_Pb_6


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  59
agttgtaatt tgaagaaggt atctttgggt ctggctcttg tcta                        44


<210>  60
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer KRUS_rRNA_F_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (23)..(23)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  60
tcgtgaatca tcgagttctt gaa                                               23


<210>  61
<211>  16
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer KRUS_rRNA_R_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (16)..(16)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  61
acacgtcgtc cgctcc                                                       16


<210>  62
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe KRUS_rRNA_Pb_1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-c3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  62
tttgagcgtc gtttccatct tgcgcg                                            26


<210>  63
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer GLAB_rRNA_F_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  63
aagtaaactc cactgtgtgt agtaa                                             25


<210>  64
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer GLAB_rRNA_R_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  64
agtgtgcgtg gatctctcta                                                   20


<210>  65
<211>  34
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe GLAB_rRNA_Pb_1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  65
agtgtcgagt cgtgtgataa aacacctcct ttgg                                   34


<210>  66
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe AVAG_23s_Pb_2_H_Q6


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (6)..(7)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  66
aagcatctaa gcgggaagcc catccca                                           27


<210>  67
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer AVAG_23S_F_5


<220>
<221>  modified_base
<222>  (19)..(19)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  67
gccccagtca aactaccca                                                    19


<210>  68
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer AVAG_23S_R_5


<220>
<221>  modified_base
<222>  (3)..(3)
<223>  7-deaza dG

<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  68
tgggagactg tgaactggag a                                                 21


<210>  69
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe AVAG_23S_Pb_5


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  modified_base
<222>  (4)..(4)
<223>  7-deaza dG

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(8)
<223>  BHQ-2 Quencher

<220>
<221>  modified_base
<222>  (27)..(27)
<223>  7-deaza dG

<400>  69
aagggttagg atgccgaaac gtcgagggt                                         29


<210>  70
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer AVAG_23S_F_3


<220>
<221>  modified_base
<222>  (19)..(19)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  70
cggtcccctt cccggatta                                                    19


<210>  71
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer AVAG_23S_R_6


<220>
<221>  modified_base
<222>  (23)..(23)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  71
cgtgaacctt tactgcagct tga                                               23


<210>  72
<211>  26
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe AVAG_tufA_Pb_4


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(8)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  72
aggctcctga agagcgtcaa cgtggt                                            26


<210>  73
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer LBS_LDH_R_3


<220>
<221>  modified_base
<222>  (28)..(28)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  73
cataaatact tgaccaatgt gaccagta                                          28


<210>  74
<211>  36
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe LBS_LDH_PB_3


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` FAM

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (8)..(9)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  74
tgaagttcgt gaccaagttg ttggtgttgt aggtac                                 36


<210>  75
<211>  45
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe CVS_rRNA_Pb_3


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (9)..(10)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  75
tttcactctc ttttcaaagt gcttttcatc tttccttcac agtac                       45


<210>  76
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer CAPT_rRNA_F_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (29)..(29)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  76
agtccgagtt gtaatttgaa gaaggtatc                                         29


<210>  77
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer CAPT_rRNA_R_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (23)..(23)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  77
tgcattccca aacaactcga ctc                                               23


<210>  78
<211>  28
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe CAPT_rRNA_Pb_2


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (10)..(11)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  78
acgtcacaga gggtgagaat cccgtgcg                                          28


<210>  79
<211>  24
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer KRUS_rRNA_F_3


<220>
<221>  modified_base
<222>  (24)..(24)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  79
ggtaattcca gctccaatag cgta                                              24


<210>  80
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer KRUS_rRNA_R_3


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  80
gcctgctttg aacactctaa tttcc                                             25


<210>  81
<211>  27
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe KRUS_rRNA_PB_3


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` JA270

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (8)..(9)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  81
taagcactgt tgcggccggg tctttcc                                           27


<210>  82
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer KRUS_rRNA_F_4


<220>
<221>  modified_base
<222>  (25)..(25)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  82
agttgttgca gttaaaaagc tcgta                                             25


<210>  83
<211>  33
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer KRUS_rRNA_R_4


<220>
<221>  modified_base
<222>  (33)..(33)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  83
gcgtcctatt ctattattcc atgctaatat atc                                    33


<210>  84
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer Egg_16s_F_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (6)..(6)
<223>  7-deaza dG

<220>
<221>  modified_base
<222>  (19)..(19)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  84
aactgggagg ctcgagttc                                                    19


<210>  85
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer Egg_16s_R_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (23)..(23)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  85
ccatcggtgt tcttcccgat atc                                               23


<210>  86
<211>  25
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe Egg_16s_Pb_1


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (6)..(7)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  86
aggcaggcgg aattcccggt gtagc                                             25


<210>  87
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer Egg_16s_F_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  87
ggaggctcga gttcggtaga                                                   20


<210>  88
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer Egg_16s_R_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  88
ccatcggtgt tcttcccgat a                                                 21


<210>  89
<211>  23
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe Egg_16s_Pb_2


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(8)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  89
acaccgggaa ttccgcctgc ctc                                               23


<210>  90
<211>  18
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer Prev_16s_F_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (6)..(6)
<223>  7-deaza dG

<220>
<221>  modified_base
<222>  (18)..(18)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  90
ggatggggat gcgtctga                                                     18


<210>  91
<211>  21
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer Prev_16s_R_1


<220>
<221>  modified_base
<222>  (21)..(21)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  91
gtttggaccg tgtctcagtt c                                                 21


<210>  92
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer Prev_16s_R_2


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  92
cctcccgtag gagtttggac                                                   20


<210>  93
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer Prev_16s_R_3


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  93
gcctcccgta ggagtttgga                                                   20


<210>  94
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe Prev_16s_Pb_2


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(8)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  94
tcagtagggg ttctgagagg aaggtcccc                                         29


<210>  95
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer Prev_16s_F_4


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  95
tcaaatcagc acggccctta                                                   20


<210>  96
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer Prev_16s_F_5


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  96
ccaccgtaag gtgtgaggaa                                                   20


<210>  97
<211>  20
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Forward Primer Prev_16s_F_6


<220>
<221>  modified_base
<222>  (20)..(20)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  97
ccaccgcaag gtgcgaggaa                                                   20


<210>  98
<211>  15
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer Prev_16s_R_4


<220>
<221>  modified_base
<222>  (15)..(15)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  98
gcacccccgg ctttc                                                        15


<210>  99
<211>  16
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer Prev_16s_R_5


<220>
<221>  modified_base
<222>  (16)..(16)
<223>  t-butylbenzyl dC

<400>  99
ggcacccccg gctttc                                                       16


<210>  100
<211>  19
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Reverse Primer Prev_16s_R_6


<220>
<221>  modified_base
<222>  (19)..(19)
<223>  t-butylbenzyl dA

<400>  100
catggctgat gcgcgatta                                                    19


<210>  101
<211>  31
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe Prev_16s_Pb_4


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (7)..(8)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  101
accccacgaa gctggattcg ctagtaatcg c                                      31


<210>  102
<211>  29
<212>  DNA
<213>  Artificial Sequence

<220>
<223>  Probe Prev_16s_Pb_5


<220>
<221>  misc_feature
<223>  5` HEX

<220>
<221>  misc_feature
<223>  3` Spacer-C3 Blocker

<220>
<221>  modified_base
<222>  (1)..(1)
<223>  7-deaza dG

<220>
<221>  misc_feature
<222>  (8)..(9)
<223>  BHQ-2 Quencher

<400>  102
ggtctgcaac ccgaccccac gaagctgga                                         29


