Основная особенность этого Договора состоит в том, что Договаривающееся государство, которое разрешает депонирование микроорганизмов для целей патентной процедуры или требует этого, должно признавать депонирование микроорганизма для соответствующих целей в любом «международном органе по депонированию», независимо от того, находится ли такой орган на территории этого государства или за его пределами.
Условием выдачи патента является раскрытие изобретения. Обычно раскрытие осуществляется путем описания изобретения. Если изобретение связано с микроорганизмом или его использованием, раскрытие с помощью описания невозможно и может осуществляться только путем депонирования образца микроорганизма в специализированном учреждении. На практике термин «микроорганизм» трактуется в широком смысле и означает биологический материал, депонирование которого обязательно для целей раскрытия, в частности в случае изобретений в пищевой и фармацевтической областях.
С целью устранения необходимости депонировать микроорганизм в каждой отдельно взятой стране, где испрашивается охрана, Договор предусматривает, что депонирования в любом «международном органе по депонированию» достаточно для патентной процедуры в национальных патентных ведомствах всех Договаривающихся государств и в любом региональном патентном ведомстве (если такое региональное ведомство заявляет, что признает действие Договора). Такие заявления сделали Европейское патентное ведомство (ЕПВ), Евразийская патентная организация (ЕАПО), Африканская организация интеллектуальной собственности (АОИС) и Африканская региональная организация интеллектуальной собственности (АРОИС).
Орган, называемый в Договоре «международным органом по депонированию», является научным учреждением – как правило, «коллекцией культур» – способным обеспечить хранение микроорганизмов. Такое учреждение приобретает статус «международного органа по депонированию» в результате предоставления Договаривающимся государством, на территории которого это учреждение находится, Генеральному директору ВОИС заверений в том, что упомянутое учреждение отвечает и будет и далее отвечать определенным требованиям, сформулированным в Договоре.
По состоянию на 26 января 2023 года общее число таких органов составляло 49: семь в Соединенном Королевстве, четыре в Республике Корея, по три в Китае, Индии, Италии, Польше и Соединенных Штатах Америки, по два в Австралии, Японии, Российской Федерации и Испании и по одному в Бельгии, Болгарии, Канаде, Чили, Чешской Республике, Финляндии, Франции, Германии, Венгрии, Латвии, Мексике, Марокко, Нидерландах, Словакии и Швейцарии.
Договор делает патентную систему Договаривающегося государства более привлекательной, поскольку создает преимущества для депозитора, подающего патентные заявки в нескольких Договаривающихся государствах; депонирование микроорганизма в порядке, предусмотренном Договором, сокращает расходы депозитора и повышает его защищенность. Депозитор экономит средства благодаря тому, что вместо депонирования микроорганизма в каждом Договаривающемся государстве, где подается заявка на патент, связанный с данным микроорганизмом, достаточно одного депонирования в одном специализированном органе. Договор повышает защищенность депозитора, создавая единую систему депонирования, распознавания и предоставления образцов микроорганизмов.
Договор не предусматривает формирование бюджета, однако он учреждает Союз и Ассамблею, членами которых являются государства – участники Договора. Основная задача Ассамблеи – внесение поправок в Инструкцию к Договору. Ни одно государство не обязано платить взносы в Международное бюро ВОИС на основании его членства в Будапештском союзе или создавать «международный орган по депонированию».
Будапештский договор был заключен в 1977 году.
Договор открыт для государств – участников Парижской конвенции по охране промышленной собственности (1883 г.). Ратификационные грамоты или акты о присоединении должны сдаваться на хранение Генеральному директору ВОИС.